SnowLeopardでiTermを使っていて、なぜか screen すると Windows が勝手に小さくなってしまって困っていたのですが、設定がありました。

　Bookmarks -> Mangae Profiles で、使っているプロファイルを開きます。

　そのなかで、

Disable session-initiated window resizing

という項目をチェックすると、勝手にリサイズされなくなりました。